El CJRM pretende ser un lugar de cooperación entre asociaciones que tengan en común intereses, objetivos, retos,... Los espacios de trabajo conjunto por áreas del Consejo son las Conferencias Sectoriales y las Mesas Sectoriales.

Conferencias Sectoriales

Son encuentros temáticos entre Asociaciones y grupos de jóvenes para abordar el conocimiento, estudio y reflexión sobre un tema en concreto (por ejemplo educación, medio ambiente,...) objeto de interés de las organizaciones participantes. Cada Conferencia establece con un documento de conclusiones o propuestas a desarrollar en ese área o materia, con posterioridad a la conferencia un grupo de expertos se reune para concretar y dar forma a las conclusiones obtenidas.

Mesas Sectoriales

Son mesas de trabajo conjunto entre asociaciones o grupos de jovenes y están organizadas también por temáticas. Surgen por iniciativa de organizaciones miembro del Consejo que deseen cooperar en un área en concreto. Contando con la colaboración de la Comisión Permanente las mesas han de ser autónomas en su propia organización.
Las mesas sectoriales están pensadas para un trabajo entre organizaciones continuado en el tiempo.